針葉2針一束,硬直,常扭曲,長4-9厘米,很少達12厘米,徑1.5-2毫米,先端尖,邊緣有細鋸齒,兩面均有氣孔線;橫切面半圓形,微扁,皮下層細胞單層,維管束鞘呈橫繭狀,二維管束距離較遠,樹脂道6-11個,邊生;葉鞘基部宿存,黑褐色。
雄球花圓柱狀卵圓形,長5-10毫米,聚生新枝下部,長約3-6厘米;雌球花有短梗,淡紫褐色,當年生小球果長約1厘米,下垂。
球果卵圓形或長卵圓形,長3-6厘米,徑2-3厘米,成熟前綠色,熟時淡褐灰色,熟后開始脫落;中部種鱗的鱗盾多呈斜方形,縱脊橫脊顯著,肥厚隆起,多反曲,鱗臍呈瘤狀突起,有易脫落的短刺。
種子黑褐色,長卵圓形或倒卵圓形,微扁,長4.5-5.5毫米,連翅長1.1-1.5厘米;子葉6-7枚,長1.3-2.4厘米;初生葉條形,長1.8-2.4厘米,上面有凹槽,邊緣有較密的細鋸齒,葉面上亦有疏生齒毛。花期5-6月,球果第二年9-10月成熟。
樟子松的雌球花、球果種鱗的形狀、小枝的色澤以及針葉的質(zhì)地與歐洲赤松都相似,惟老樹樹干下部的樹皮較厚,深縱裂,灰褐色或黑褐色,上部樹皮黃色至褐黃色,裂成薄塊片脫落;針葉長短變異頗大,最長可達12厘米,徑1.5-2毫米,冬芽淡褐黃色等形態(tài)特征與歐洲赤松不同。樟子松的樹形因生長環(huán)境不同而有所不同:生于大興安嶺山區(qū)的樹木樹冠成尖塔形,樹干端直高大;生于海拉爾以西與以南砂丘地區(qū)的樹木,則樹冠平頂,樹干較短。這兩種類型是否需要劃分,有待進一步研究。